Τα επόμενα χρόνια το Μαρούσι εξελίχτηκε στη μεγαλύτερη… μικρή ομάδα της χώρας, φτάνοντας ως τα ημιτελικά του Κυπέλλου Κόρατς (2002) και στον τελικό του FIBA EuroChallenge (2004), παίζοντας δυο φορές στον τελικό του Κυπέλλου Ελλάδας (2002, ’06) και συμμετέχοντας στους τελικούς της Α1 (2004). Σε κάθε περίπτωση, η πορεία της ομάδας ήταν άρρηκτα συνδεδεμένη με την οικογένεια Βωβού που είχε έντονη δραστηριότητα στην πόλη του Αμαρουσίου όσον αφορά τον κατασκευαστικό τομέα, με τη Λεωφόρο Κηφισίας να μετονομάζεται σε… Βωβούπολη. Όσο θρυλική όμως ήταν η άνοδος της οικογένειας, το ίδιο ηχηρή αποδείχθηκε η πτώση. Η οικονομική κρίση και το χαμένο στοίχημα του Βοτανικού διαδραμάτισαν κομβικό ρόλο ώστε από το 2012 και μετά ο όμιλος να μπει στον ολισθηρό κατήφορο. Η αρνητική εξέλιξη στο θέμα του εμπορικού κέντρου που ήθελε να ανεγείρει η κατασκευαστική εταιρεία Βωβού στον χώρο όπου επρόκειτο να ανεγερθεί το γήπεδο του Παναθηναϊκού στον Βοτανικό δημιούργησε τεράστιο πρόβλημα στην εταιρεία. Έτσι, λοιπόν η οικογένεια πήρε την απόφαση πως η ενασχόληση με το μπάσκετ ήταν αβάσταχτη πολυτέλεια. Οι μετοχές της ΚΑΕ μεταβιβάστηκαν από τον ιδιοκτήτη Άρη Βωβό στους Γιώργο Γκάμαρη, Θανάση Μαρή που εν τέλει αποδείχτηκαν αφερέγγυοι και αποχώρησαν… κακήν κακώς από τον σύλλογο. Το προσύμφωνο για την αλλαγή στο ιδιοκτησιακό καθεστώς ακυρώθηκε και η ΚΑΕ πέρασε στα χέρια του Ερασιτέχνη. Ο Βασίλης Κωνσταντίνου, παλαίμαχος γκολκίπερ του Παναθηναϊκού και βετεράνος γκαρντ του Αμαρουσίου ανέλαβε χρέη προέδρου στους «κιτρινόμαυρους» που βίωναν πια την ελεύθερη πτώση.
Η άγονη γραμμή, το comeback και ο Στασινός
Η οικονομική κατάρρευση της οικογένειας Βωβού και των επιχειρήσεών της οδήγησε σταδιακά στη διάλυση της ομάδας μπάσκετ του Γ.Σ.Α. που άρχισε να πέφτει με ρυθμό εξπρές. Τη σεζόν 2014-15, μόλις 14 χρόνια μετά από τη μαγική βραδιά της Βαρσοβίας, το Μαρούσι τερμάτισε στη 13η θέση μεταξύ 14 ομάδων στη Β’ Εθνική με ρεκόρ 5-21 και υποβιβάστηκε στην τελευταία εθνική κατηγορία του ελληνικού μπάσκετ, παίζοντας με εξίσου ιστορικές ομάδες όπως ο Ηλυσιακός και ο Σπόρτιγκ που βρέθηκαν στην άγονη γραμμή. Για όποιον ανέβαινε στην Κηφισίας, υπήρχαν ακόμη τα κτίρια με την επωνυμία της οικογένειας Βωβού και στις προθήκες του Αγίου Θωμά το Κύπελλο Σαπόρτα για να θυμίζουν ότι σε αυτά τα μέρη… ήταν κάποτε μια ομάδα που την έλεγαν Μαρούσι. Σε κάθε περίπτωση, ο Γ.Σ.Α επιβίωσε σε αυτή τη διαδικασία. Μετά από 11 χρόνια, επέστρεψε στην Basket League με θριαμβευτικό τρόπο, έχοντας στο ρόστερ του τον Ορφέα Στασινό, τον γιο του βετεράνου σκόρερ και ενός εκ των κορυφαίων σουτέρ της Α2, Νίκου Στασινού ο οποίος έχει βγει από τις ακαδημίες της ομάδας και αποτελεί βασικό στέλεχος σε αυτή τη διαδρομή από τις εθνικές κατηγορίες ως την επιστροφή στο top επίπεδο. Ο βραχύσωμος γκαρντ, ο οποίος εντάχθηκε στον Ήφαιστο Λήμνου τη σεζόν 2019-20 κι εν συνεχεία επέστρεψε στα βόρεια προάστια αποτελεί πλέον τη «σημαία» του τμήματος, πανηγυρίζοντας μαζί της την άνοδο.
